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中國網(wǎng)/中國發(fā)展門戶網(wǎng)訊 生命科學的迅速發(fā)展使得我們從生物遺傳信息的“讀取”階段進入到后基因組時代,基因組的“改寫”乃至“全新設(shè)計”正逐漸成為現(xiàn)實。以設(shè)計創(chuàng)造新生命體為目標的合成生物學在此背景下迅速發(fā)展,并在醫(yī)藥、制造、能源等領(lǐng)域顯現(xiàn)了巨大的應(yīng)用前景?;蚪M的從頭合成和針對天然基因組的規(guī)模改造分屬合成基因組學和基因編輯領(lǐng)域,均為當前合成生物學研究的熱點。合成基因組學涉及基因組的從頭設(shè)計、構(gòu)建和功能表征等,屬于自下而上的生物學研究策略;而基因編輯側(cè)重于通過對現(xiàn)有基因組進行刪除、替換、插入等分子操作,進而改寫遺傳信息,屬于自上而下的生物學研究策略。以上兩者的有機結(jié)合將極大地推動生物制造、疾病治療等領(lǐng)域的革新;同時二者也將為后基因組時代,功能基因組學的研究提供強有力的技術(shù)手段。新生命體系的從頭設(shè)計與合成不僅需要基因組序列的合成、拼接及轉(zhuǎn)移等技術(shù),也需要高效率、低脫靶率的編輯技術(shù)以實現(xiàn)在基因組上進行大規(guī)模的編輯改造。在不斷的探索研究中,基因編輯技術(shù)已經(jīng)從最初依賴細胞自然發(fā)生的同源重組,發(fā)展到幾乎可在任意位點進行的靶向切割,其操作的簡易和高效極大地推動了物種遺傳改造的發(fā)展?;蚓庉嬁蔀楹铣缮倪M一步改造提供手段,為新物種的創(chuàng)造提供更多的可能性。
基因編輯的原理
基因編輯技術(shù)是對生物體?DNA?斷裂的現(xiàn)象及其修復(fù)機制的應(yīng)用。作為一種常見的分子生物學事件,在分裂活躍的哺乳動物細胞中,DNA?雙鏈斷裂(DNA double-strand breaks,DSBs)每天會發(fā)生。DSBs?發(fā)生后細胞可以通過多種方式進行修復(fù),包括經(jīng)典的非同源末端修復(fù)(non-homologous end joining,NHEJ),選擇性末端修復(fù)(alternative end joining,a-EJ),單鏈退火修復(fù)(single-strand annealing,SSA)和同源重組修復(fù)(homologous recombination,HR)。HR?可以進行精確無誤的修復(fù),但是需要同源模板的存在;NHEJ?則是將很大程度上沒有同源性的兩個?DNA?末端直接連接實現(xiàn)修復(fù)[7],此過程中,兩個末端在大多數(shù)情況下都會發(fā)生若干核苷酸的缺失,是一種不精確的修復(fù)機制。而作為輔助性的修復(fù)機制,a-EJ?和?SSA?均需要更大幅度的末端單鏈切除,這也會導(dǎo)致遺傳信息的丟失?;?DNA?斷裂修復(fù)的原理,如果在細胞中人為提供特定的同源重組模板,待目標?DNA?自然發(fā)生或者人為誘導(dǎo)產(chǎn)生?DSBs,觸發(fā)同源重組修復(fù),就有機會把特定?DNA?序列進行刪除或者插入外源基因。在不提供同源模板的情況下,利用?NHEJ、a-EJ?及?SSA?的不精確修復(fù)機制可以實現(xiàn)基因的突變和敲除。傳統(tǒng)的基因編輯借助細胞內(nèi)自然發(fā)生的?DSBs?實現(xiàn)靶向整合,達到基因敲除、替換等目的。然而,在真核生物細胞里面,通過自發(fā)雙鏈斷裂實現(xiàn)目的基因編輯的概率通常低至百萬分之一。人為使用化學誘導(dǎo)劑或者輻射處理等方法,或者使用轉(zhuǎn)座子技術(shù)也可以實現(xiàn)基因的突變,但是這些突變是隨機的,需要后續(xù)進行大量的篩選工作來獲得所需的基因型。定點基因編輯技術(shù)是進行基因功能研究和物種定向改造的優(yōu)選策略。